המחלקה הרפואית בגיאוקרטוגרפיה מתמחה במחקרי שיווק רפואיים ובמחקרים אפידמיולוגיים, ומספקת שירותי מחקר למרבית חברות התרופות הבינלאומיות והמקומיות בישראל, ולגופים מענפי הבריאות והרפואה.
המחלקה מבצעת מחקרים בקרב רופאים, רוקחים, סגל רפואי ולקוחות קצה (מטופלים והציבור הרחב), ומפעילה מגוון רחב של מודלים ושיטות מחקר איכותני וכמותי, הן בקרב הציבור הרחב והן בקרב חברי סגל רפואי ואוכלוסיות מקצועיות כמו רופאים, רוקחים, אחיות וכו'.